Correlation Engine 2.0
Clear Search sequence regions


  • acceptor (3)
  • adult (2)
  • adult- disease (1)
  • agar (1)
  • allele (3)
  • ALM (11)
  • amino acid (4)
  • ampa receptors (1)
  • ampicillin (1)
  • anti- igg (2)
  • antibodies (1)
  • antigen (2)
  • axon hillock (1)
  • behavior (1)
  • blue (1)
  • calcium (1)
  • calmodulin (1)
  • cdc 42 (1)
  • cdc- gene (1)
  • Cdk1 (1)
  • Cdk5 (2)
  • cdna (1)
  • cfp (7)
  • cluster analysis (1)
  • collect data (1)
  • consistency (1)
  • contour (2)
  • control group (1)
  • data analysis (2)
  • data file (2)
  • dfd (4)
  • disease parkinson (2)
  • distances (6)
  • Dliprin α (1)
  • DLK (1)
  • donor (4)
  • drosophila (4)
  • dynein (5)
  • Eg5 (1)
  • ERK1 (1)
  • escherichia coli (1)
  • essential (4)
  • exons (2)
  • factors (2)
  • FN3 (2)
  • gene insert (1)
  • genes (18)
  • GIT 1 (1)
  • GSK3β (1)
  • human (1)
  • IAR (2)
  • igg hrp (2)
  • introns (1)
  • iptg (1)
  • isoforms (10)
  • KIF1A (193)
  • kinesin like proteins (1)
  • kinesins (9)
  • LIN 2 (3)
  • LIP 1 (1)
  • lipids (1)
  • liprins (2)
  • LSKMAGG10 (1)
  • magenta (1)
  • MAPKs (1)
  • MKlp2 (1)
  • morphogenesis (1)
  • motor activity (1)
  • motor function (1)
  • mrna (4)
  • nervous system (3)
  • northern blot (1)
  • nucleic acids (1)
  • nucleotides (1)
  • oil (2)
  • organelles (2)
  • p38 mapks (1)
  • particles (13)
  • particles sizes (1)
  • phenotypes (4)
  • phosphatases (2)
  • PINK1 (1)
  • plasmid (27)
  • PP2A (1)
  • protein G (2)
  • protein levels (2)
  • protein transport (2)
  • PTEN (1)
  • ptp (1)
  • PTPR (1)
  • PTPRD (3)
  • PTPRF (110)
  • Punc (157)
  • pvdf (1)
  • RAB 3 (1)
  • rabbit (1)
  • rat (1)
  • reagent (1)
  • receptor (1)
  • receptor d (1)
  • regulates (5)
  • regulates transport (2)
  • relates (1)
  • rna (16)
  • SAD 1 (1)
  • sds page (2)
  • segments (5)
  • serum albumin (1)
  • signals (9)
  • SNB 1 (47)
  • soma (7)
  • stage l1 (1)
  • strains (17)
  • student (2)
  • STVs (13)
  • SYD 1 (1)
  • SYD 2 (183)
  • SYG 1 (1)
  • synapse (18)
  • syntaxin (1)
  • target proteins (1)
  • triplet (1)
  • trizol (1)
  • UNC 10 (3)
  • UNC 16 (1)
  • uracil (1)
  • venus (4)
  • vesicle transport (4)
  • VNCs (2)
  • western blot (1)
  • Wnd (1)
  • YFP (2)
  • young adult (5)
  • Sizes of these terms reflect their relevance to your search.

    UNC-104 is the Caenorhabditis elegans homolog of kinesin-3 KIF1A known for its fast shuffling of synaptic vesicle protein transport vesicles in axons. SYD-2 is the homolog of liprin-α in C. elegans known to activate UNC-104; however, signals that trigger SYD-2 binding to the motor remain unknown. Because SYD-2 is a substrate of PTP-3/LAR PTPR, we speculate a role of this phosphatase in SYD-2-mediated motor activation. Indeed, coimmunoprecipitation assays revealed increased interaction between UNC-104 and SYD-2 in ptp-3 knockout worms. Intramolecular FRET analysis in living nematodes demonstrates that SYD-2 largely exists in an open conformation state in ptp-3 mutants. These assays also revealed that nonphosphorylatable SYD-2 (Y741F) exists predominately in folded conformations, while phosphomimicking SYD-2 (Y741E) primarily exists in open conformations. Increased UNC-104 motor clustering was observed along axons likely as a result of elevated SYD-2 scaffolding function in ptp-3 mutants. Also, both motor velocities as well as cargo transport speeds were visibly increased in neurons of ptp-3 mutants. Lastly, epistatic analysis revealed that PTP-3 is upstream of SYD-2 to regulate its intramolecular folding.

    Citation

    Muthaiyan Shanmugam Muniesh, Syed Nooruzuha Barmaver, Hsin-Yi Huang, Odvogmed Bayansan, Oliver Ingvar Wagner. PTP-3 phosphatase promotes intramolecular folding of SYD-2 to inactivate kinesin-3 UNC-104 in neurons. Molecular biology of the cell. 2020 Dec 15;31(26):2932-2947


    PMID: 33147118

    View Full Text